
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC思路: 通过Tn5转座酶(在染色质开放区域各种切割,形成复合物后插入到靶序列)来富集开放染色质的DNA序列,PCR扩增后NGS测序。 官方一点的话:DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的 …
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC思路: 通过Tn5转座酶(在染色质开放区域各种切割,形成复合物后插入到靶序列)来富集开放染色质的DNA序列,PCR扩增后NGS测序。 官方一点的话:DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的 …
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC-Seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是使用高通量测序对Tn5转座酶可接近的核染色质区域进行测序分析的一种研究技术,通过研究特定细胞状态下 …
atac-seq和chip-seq的区别? - 知乎
ATAC-seq 分析流程 (from Novogene) 与其他常用技术的比较: ChIP-seq:直接检测与转录因子结合的DNA序列,但 一次测序只能提供一个转录因子的信息,检出率相对较低。 DNase-seq:利 …
想要做单细胞测序,包括RNA-seq,CHIP-seq,ATAC-seq,Hi-c,求推 …
Jan 15, 2024 · 联合RNA-seq和ATAC-seq,研究发现染色质开放且表达上调的基因(如MYO5C、RHOB)与肌动蛋白重组有关,而染色质封闭且表达下调的基因(如MYB和CDK6)与细胞增殖有关 …
ATAC 或 chip-seq中peak 图,下方基因位置中方框、箭头代表什么意思?
Oct 24, 2022 · 康测科技为本研究提供ATAC-seq,ChIP-seq和UMI lncRNA-seq技术服务。 该研究将每个组织阶段中ATAC-seq与H3K27ac信号进行重叠取其交集,将这个交集区域定义为高置信度的活性顺 …
分析单细胞atac数据比较全面的工具是只有archar和signac麽?
单细胞ATAC-seq基于10x Genomics Chromium平台,将高通量单细胞捕获与ATAC-seq技术完美结合。 :核心是利用工程化改造的 Tn5转座酶。 该酶能特异性地识别并切割基因组中的开放染色质区域, …
利用HiC数据和ATACseq数据怎样鉴定增强子?或者有相关的文献嘛?
Dec 22, 2021 · ATACseq - 使用转座酶并提供一种同时从单个样本的转录因子结合位点和核小体位置提取信号的方法。 1. 数据类型 上面这意味着我们的数据中可能包含多种信号类型。 我们将从无核小体区 …
请问chip-seq这个技术存在的意义是什么啊,我知道他是蛋白抓手,但 …
b. ATAC-seq使用高活性的tn5转座酶识别开放染色质的区域,该转座酶优先插入到可接近的染色质中,并用测序适配器标记这些位置。 微量细胞的CHIP技术 传统CHIP-seq的主要限制因素是需要大量的细 …
ATAC-seq-学习笔记 - 知乎
ATAC-seq学习笔记,结合RNAseq与ATAC-seq的整合思路,提供对染色质开放性和转录因子结合位点的深入理解。